Het verhaal gaat over een vis Nemo genaamd die erg beschermd wordt door zijn vader (Martin). De vader zegt dat Nemo niet goed kan zwemmen omdat hij aan 1 kant een kleine vin heeft. Op een dag gaat Nemo naar school maar liever wil zijn vader dat niet omdat hij bang is dat er wat met Nemo gebeurt. Als Nemo dan met zijn school door de zee gaat zwemmen, zien Nemo en zijn vriendjes een boot liggen, ze doen een spelletje wie het dichtst bij de boot durft te komen. Opeens komt Nemo’s vader naar hem toegezwommen en verbiedt Nemo om naar de boot te zwemmen. Toch doet Nemo het en raakt zelfs de boot aan, Nemo komt dur terug zwemmen maar als hij terug wil zwemmen komt er opeens een duiker voor hem zwemmen en vangt Nemo in een zakje en zwemt terug naar de boot, klimmen aan boord en vertrekken. Martin, de vader van Nemo, probeert achter de boot aan te zwemmen maar tevergeefs.
Nu begint het verhaal pas echt de zoektocht naar Nemo ( Finding Nemo ).
Martin probeert de boot nog in te halen maar hij raakt de boot kwijt, hij zwemt verder en botst tegen een andere vis aan ze raken aan de praat en de vis (Dori) helpt Martin om zijn zoon te vinden. Ze zwemmen de hele oceaan rond om maar iets van Nemo te vernemen maar tevergeefs.Maar dan opeens ziet Martin een duikersbril die 1 van die duikers op had en er staat iets opgeschreven. Het is het adres van de duiker!!! Er is weer nieuwe hoop en Martin en Dori zoeken verder ze vragen aan iedereen of ze weten waar dat adres te vinden is.
Nemo is ondertussen in een aquarium van de tandarts terecht gekomen en heeft daar vrienden gemaakt die hem wel willen helpen terug in de oceaan te komen. Ze proberen vanalles om Nemo uit het aquarium te krijgen want over 2 dagen komt het nichtje van de tandarts Nemo ophalen als kadootje.
Martin en Dori komen in de meeste gevaarlijke omstandigheden terecht, maar komen er wel uit, en iedereen heeft het over Martin de vader die zijn zoon Nemo zoekt en al bijna dood is geweest, dat verspreid zich door heen de oceaan en komt ook viavia naar Nemo toe. Dus Nemo doet er alles aan om vrij te komen maar niks lukt. Tot de dag dat het nichtje van de tandarts komt Nemo wordt uit het aquarium gehaald en om een tafel gelegd. 1 van Nemo’s vrienden springt uit het aquarium en vliegt ook op de tafel waar Nemo op ligt, waardoor Nemo in de lucht vliegt en in de gootsteen komt en wordt doorgespoelt naar de zee waar Martin op hem aan het wachten is.
Martin en Nemo zijn weer bij elkaar en voortaan vindt Martin het niet meer erg om Nemo naar school te laten gaan en laat hij Nemo veel vrijer!!